2009年12月，经深圳市投资控股有限公司批准，并在科技部火炬中心等有关单位的大力支持下，中国科技开发院全资子公司“东莞市中科科技企业加速器有限公司”正式成立。东莞市中科科技企业加速器有限公司为全资国有企业，位于东莞市松山湖国家级科技产业园区北部IT产业园，总投资约4.5亿元人民币，占地面积3万余平方米，建筑面积约11.5万平方米。2010年12月底开始建设，2013年初投入试运营。现有员工12人，正式建成运营后，预计将形成40人的专业服务团队。